Эмиль Фишер — один из выдающихся представителей классической органической химии. Он занимался препаративной органической химией, изучением строения органических природных веществ, заложил основы биохимии.
Научная деятельность Фишера началась в так называемый период грюндерства, когда промышленность в Германии бурно развивалась за счет контрибуций, наложенных на побежденную Францию. Наряду с созданием машиностроения и электротехнической промышленности в Рейнской области и в Берлине возникли первые крупные химические предприятия, где на основе достижений органической химии было организовано производство красителей, а вскоре также лекарств и взрывчатых веществ. За короткое время в Германии возникло сорок два новых акционерных общества по промышленному производству химических продуктов. Некоторые из них вскоре погибли в конкурентной борьбе, другие же, наоборот, заняли монопольное положение в химической промышленности не только Германии, но и на мировом рынке.